Vid en typisk FUE görs en liten rund punch görs i givarområdet för att direkt extrahera hårsäcken som består av 1, 2, 3 och 4 hår dvs transplantat av follikulära enheter. De follikulära enheter som extraheras med den här processen kallas vanligtvis "trubbigt dissektion " där en punch görs för att innesluta hela den follikulära enheten som separerar den från de omgivande mjukvävnaderna.
När den underliggande follikulära enheten är separerad från den omgivande vävnaderna, är det lätt placera tillbaka dem med hjälp av en liten pincett. De små hålen som finns kvar efter hårsäcken läker gradvis under de närmaste dagarna och upptäckas inte för blotta ögat när patientens hår växer ut. Läkningstiden är mycket kortare än de äldre metoderna med hudremsa som togs ut.
FUE förfarandet har antagits av de flesta hår transplantations kliniker och blivit standard trots det är hudremse metoden fortfarande den mest populära hårtransplantation förfarande eftersom det är mer ekonomiskt än FUE.b
Den andra metoden so används kallas för strip-metoden. Eftersom vissa hårtransplantation framsteg gjort även med den här metoden såsom användning av trichophytic closign teknik som görs för att minimera ärr som skapas av hudremsan vilket gör det nästan omöjlig att upptäcka hårtransplantationen för blotta ögat. Denna utveckling av håret transplantation tekniken har gjort FUE mindre tilltalande för kliniker trots att det är en bättre metod för patienten.